Самое древнее упоминание фамилии Кольчугиных, относящееся к 1562 году, найдено на территории Московской области у вотчинников Дмитровского уезда Московского царства (сейчас это территория Дмитровского района). Известно, что данная местность подверглась разорению во время польского нашествия в начале XVII века и в дальнейшем фамилия на территории района не встречается. Ближайшее территориально упоминание фамилии найдено в начале XX века в д. «Елындино» Богословской волости Дмитровского уезда (вероятно, современное село Ельдигино Пушкинского района), где она могла сохраняться с XVI века, но в основном фамилия фиксируется к востоку и югу от Москвы, практически не встречаясь в западных и северных частях области.
В 1941 году фамилия присутствовала в городах Павловский Посад, Ногинск, Орехово-Зуево, а также д. Левкино Павло-Посадского района. Подтверждено, что Кольчугины Павловского Посада ведут происхождение из д. Левкино. То же самое можно предположить и касательно двух оставшихся городов, учитывая их географическую близость друг к другу.
В настоящее время много Кольчугиных живет в Коломенском районе, особенно в г. Озёры. Представляется, что они могут являться наследниками помещика Федора Кольчугина владевшего землей на речке Тюфитке около г. Зарайск в 1594 году. Фамилия Кольчугиных была широко распространена в Зарайском районе (г. Зарайск, д. Клинское, д. Знаменки-1, д. Знаменки-2), а также на сопредельных территориях Серебряно-Прудского района (п. Серебряные Пруды, д. Козяево), а также Рязанской области (д. Щекотово Рыбновского района, д. Малышево Спасского района) вплоть до середины XX века.
Интерактивная карта географического распространения фамилии Кольчугин